Kronik inflamasyon, pek çok kanser türünün yayılmasında önemli bir rol oynar ve özellikle H. pylori kaynaklı mide kanserinde bu etken öne çıkar. H. pylori enfeksiyonu gastrite yol açsa da, sadece küçük bir grup bireyde bu durum kansere dönüşür. Bu durum, hastalığın ilerlemesinde konak hücrelerin verdiği yanıtın ve bakterinin sahip olduğu faktörlerin, kanser gelişimindeki asıl belirleyici unsurlar olup olmadığını sorgulatmaktadır.
Mide mukozasında uzun süreli inflamasyon, yüksek miktarda azot oksit salınımına yol açar. Bu durum, azotlu bazların hasar görmesine ve transkripsiyon düzenleme mekanizmasının bozulmasına neden olabilir. Sonuç olarak, tümör baskılayıcı genlerde hipermetilasyon oluşur ve bu epigenetik değişiklikler kanser gelişimine katkıda bulunur. Mide kanseri hastalarının mukozalarında metillenmiş tümör baskılayıcı genlerin varlığı tespit edilmiştir. Hayvanlar üzerinde yapılan deneylerde, metillenmeyi engelleyen "5-azacytidine" adlı maddenin mide kanserini azaltabileceğine dair veriler elde edilmiştir.
Helicobacter pylori, tedavi edilmediğinde kansere yol açabilecek ciddi komplikasyonlara neden olabilir. Bu bakteri, endoplazmik retikulum stresi, inflamasyon, azot oksit birikimi ve DNA metilasyonu gibi çeşitli mekanizmalarla mide hücrelerinin değişimine, kontrolsüz çoğalmasına ve diğer dokulara yayılmasına sebep olabilir.